Uso muito o past, é muito pratico para uma infinidade de testes. O R é melhor para grande numero de variáveis e um maior controle dos parâmetros da análise.
Boa tarde Newton. Fiquei com uma dúvida. No exemplo que você fez, você encontrou apenas um ponto para o índice de Jackkfield. No exemplo do seu trabalho, você encontrou vários valores, que resultaram numa curva. Gostaria de saber o que você fez?
Oi Luís, entendi. Mas o que constitui essa curva? São os valores de estimativa (do índice Jackniffe) para cada ponto da minha curva de riqueza observada. A escolha de mostrar uma curva de estimador ou apenas o último valor do estimador, é sua. E depende dos seus objetivos. Como, ao fim da amostragem, eu gostaria de saber apenas se atingi a eficiência amostral, me basta o ultimo valor do índice. Agora, se você quer demonstrar como variou a estimativa ao longo da amostragem, você mostra a curva. Deu pra entender? Espero que sim, qualquer coisa pode perguntar e se eu puder te respondo.
Olá, bom dia! Eu fiz uma curva de coletor, houve uma estabilidade, mas surgiu uma nova espécie. Por exemplo: obtive um valor de 28, 28 e 30, Eu interpretei assim, que o número de espécies, chegou ao seu patamar, mas surgiu uma nova espécie. Interpretei de maneira certa? Obrigada!
Muito bom. Lembre sempre que a curva estabilizada apenas significa que provavelmente você fez uma boa amostragem e não falta revelar nenhuma outra spp (neste método de amostragem e neste local), mas não é impossível que surjam novas spp ao longo do tempo. A natureza sempre muda, nossos estudos ecológicos são meras fotografias da agua de um rio que sempre flui.
@@heliasilvacamposcampos1962 pode sim ser uma espécie rara, no caso da sua amostragem. Por isso é muito importante saber que estimadosr de diversidade estamos usando. Dica, se sua amostragem tiver muitas espécies pouco abundantes (com 1 ou 2 indivíduos), é melhor utilizar o índice de Chao1 e Chao2.
Oi Patrick, não tenho, mas é um bom tema para um vídeo. No R você dispõe de várias maneiras e pacotes para construir uma curva. Optei por mostrar uma maneira mais fácil para os iniciantes do que utilizar o R. Mas acredito que você encontrará vários vídeos sobre isso no youtube, mas todos em inglês.
Olha ai Patrick Palassi nesse site cantinhodor.wordpress.com/ existem vários tutoriais, além de conj. de dados e scripts sobre o uso do programa R para analises estatística voltadas para a Ecologia, Conservação e Modelagem, site do Prof. Marcos Vital da UFAL, quee ministra um curso sobre o Uso do R para Biologia da Conservação com parcerias do IPÊ e da Bocaína, da uma olhada aí no site, vale muito a pena..
@@alexsandrasantos8994 Oi Alessandra. Sim, nesse exemplo eu calculei o Jack no past. No entanto, há pacotes como o BAT (Biodiversity assessment tools) que oferece o cálculo dos estimadores mais comuns ao mesmo tempo que faz o cálculo da curva de coleta. E sim, o R é gratuito
Oi Newton, queria tirar uma dúvida. Se ao invés de dias de amostragem, fossem armadilhas fotográficas em sítios por várias campanhas. Como seria o eixo x? Desde já, obrigada.
Oi Liana! No exemplo do vídeo utilizamos a unidade "dias de amostragem". Se você utilizasse número de armadilhas fotográficas não haveria problema, seria a mesma coisa, só tua tabela de abundância que mudaria (o número de colunas). Perceba que sempre que seu eixo X tiver como unidade o critério AMOSTRA (dias, pontos amostrais, câmeras traps, pitfalls, redes, armadilhas...) a rarefação utilizada no programa é a SAMPLE RAREFACTION. Recomenda-se o uso das mesmas unidades que encontramos nos bons artigos, para que assim, possamos comparar nossos resultados com outros estudos. E é justamente por isso que a unidade que deveria ser sempre adotada em todos os estudos é o "NÚMERO DE INDIVÍDUOS" (neste caso, no programa PAST, deve-se usar o comando INDIVIDUAL RAREFACTION), mas hoje a "moda" é usar unidades amostrais como unidade do eixo X. Resolvi tua dúvida?
Newton, boa tarde... Estou com essa dificuldade no meu TCC. Já inseri de diversas formas no PAST os dados para a curva de coletor, mais não consigo fazê-la estabilizar... Gostaria de saber como faço para lançar os dados corretamente no PAST e já aparecer a Curva... Sei que é o acúmulo de espécies durante os dias de coleta... Como faço?
Me passa teus dados (só os que servirão para construir a curva) no email bionewton@gmail.com . Outra coisa, caso você tenha gerado a curva mas ela não estabilizou, beleza. Isso quer dizer que você não tem suficiência amostral, desse modo a curva fica com aspecto ascendente.
@@bionewton Eu também estou com o mesmo problema do Márcio, fazendo meu TCC com morcegos e nao to conseguindo gerar a curva, você pode me ajudar? grato
Boa tarde Newton Filho, ótima explicação sobre a curva do coletor, porém achei um exercício na internet em que não consegui aplicar na prática, você poderia me mandar seu e-mail para que eu possa te enviar? Desde já agradeço pela atenção. E, obrigado por esse exemplo.
Oi, deixe ver se entendi. Você fez as curvas mas elas estão ascendentes e não apresentam sinal de estabilização? Se esse for o caso, isso indica que você precisa amostrar mais.
Newton, boa tarde! Gostei muito do seu vídeo, mas queria tirar uma dúvida... Eu tenho uma lista secundária de espécies de uma dada região e queria criar uma curva para que eu possa depois comparar com os meus dados de campo e verificar se esses dados de campo estão próximos dos da curva da lista secundária. Acho que vc passou isso e eu não entendi direito, ou eu tô confundindo tudo.
![[BIO] Cálculo do índice de diversidade de Shannon-Weaver - Ecologia II](/img/1.gif)
Nossa, que explicação boa, me salvou aqui! Consegui fazer tbm com as minhas amostras de censo de aves, muito obrigada!
Parabéns pela postagem! Assunto importante e abordado de forma clara e objetiva.
Cara. Excelente explicação. Salvou aqui. Abraço ae e sucesso!
obrigada man ajudou muito na minha tese
Muito boa aula, consegui fazer muito com o PAST sobre inventário florestal.
Uso muito o past, é muito pratico para uma infinidade de testes. O R é melhor para grande numero de variáveis e um maior controle dos parâmetros da análise.
Que legal... muita gente tem dificuldade enorme de interpretar o gráfico, mais nesse exemplo está bem explicado.. parabéns
otima explicação!
São espécies de Crisopídeos coletados em duas áreas... Cultivo convencional e orgânico...
Hoje em dia é o s(est) e os de 95% que se usa prafazer a curva do coletor??
Também fiquei com essa dúvida
Tem uma tabela p enviar? Kkkk
Boa tarde Newton. Fiquei com uma dúvida. No exemplo que você fez, você encontrou apenas um ponto para o índice de Jackkfield. No exemplo do seu trabalho, você encontrou vários valores, que resultaram numa curva. Gostaria de saber o que você fez?
É porque eu tenho visto em outros trabalhos, e a maioria encontrou foi uma curva também para o índice de Jackkfield e não apenas um ponto. Obrigado.
Oi Luís, entendi. Mas o que constitui essa curva? São os valores de estimativa (do índice Jackniffe) para cada ponto da minha curva de riqueza observada. A escolha de mostrar uma curva de estimador ou apenas o último valor do estimador, é sua. E depende dos seus objetivos. Como, ao fim da amostragem, eu gostaria de saber apenas se atingi a eficiência amostral, me basta o ultimo valor do índice. Agora, se você quer demonstrar como variou a estimativa ao longo da amostragem, você mostra a curva. Deu pra entender? Espero que sim, qualquer coisa pode perguntar e se eu puder te respondo.
No past você obterá só o valor final do estimador, existem opções mais avançadas no R para montar a curva.do estimado.
entao no lugar de dias, dá p usar parcelas p anotar os dados no excel?
Sim. Você que escolhe a unidade amostral
Olá, bom dia! Eu fiz uma curva de coletor, houve uma estabilidade, mas surgiu uma nova espécie. Por exemplo: obtive um valor de 28, 28 e 30, Eu interpretei assim, que o número de espécies, chegou ao seu patamar, mas surgiu uma nova espécie. Interpretei de maneira certa? Obrigada!
Muito bom. Lembre sempre que a curva estabilizada apenas significa que provavelmente você fez uma boa amostragem e não falta revelar nenhuma outra spp (neste método de amostragem e neste local), mas não é impossível que surjam novas spp ao longo do tempo. A natureza sempre muda, nossos estudos ecológicos são meras fotografias da agua de um rio que sempre flui.
@@bionewton Neste caso, interpretei de maneira errada? Estabilizou mas não surgiu espécie nova, por ter aumentado, seria uma espécie rara?
@@heliasilvacamposcampos1962 pode sim ser uma espécie rara, no caso da sua amostragem. Por isso é muito importante saber que estimadosr de diversidade estamos usando. Dica, se sua amostragem tiver muitas espécies pouco abundantes (com 1 ou 2 indivíduos), é melhor utilizar o índice de Chao1 e Chao2.
Boa Tarde, você tem um video aula de utilização do "R" para calcular a curva de acumulação?
Oi Patrick, não tenho, mas é um bom tema para um vídeo. No R você dispõe de várias maneiras e pacotes para construir uma curva. Optei por mostrar uma maneira mais fácil para os iniciantes do que utilizar o R. Mas acredito que você encontrará vários vídeos sobre isso no youtube, mas todos em inglês.
Olha ai Patrick Palassi nesse site cantinhodor.wordpress.com/ existem vários tutoriais, além de conj. de dados e scripts sobre o uso do programa R para analises estatística voltadas para a Ecologia, Conservação e Modelagem, site do Prof. Marcos Vital da UFAL, quee ministra um curso sobre o Uso do R para Biologia da Conservação com parcerias do IPÊ e da Bocaína, da uma olhada aí no site, vale muito a pena..
é um ótimo tema para um video. também é miha dificuldade
Então na verdade você utilizou o Past apenas para calcular o jacknife e montou o gráfico no R?
o R é gratuito?
@@alexsandrasantos8994 Oi Alessandra. Sim, nesse exemplo eu calculei o Jack no past. No entanto, há pacotes como o BAT (Biodiversity assessment tools) que oferece o cálculo dos estimadores mais comuns ao mesmo tempo que faz o cálculo da curva de coleta. E sim, o R é gratuito
@@bionewton obrigada
Oi Newton, queria tirar uma dúvida. Se ao invés de dias de amostragem, fossem armadilhas fotográficas em sítios por várias campanhas. Como seria o eixo x? Desde já, obrigada.
Oi Liana! No exemplo do vídeo utilizamos a unidade "dias de amostragem". Se você utilizasse número de armadilhas fotográficas não haveria problema, seria a mesma coisa, só tua tabela de abundância que mudaria (o número de colunas). Perceba que sempre que seu eixo X tiver como unidade o critério AMOSTRA (dias, pontos amostrais, câmeras traps, pitfalls, redes, armadilhas...) a rarefação utilizada no programa é a SAMPLE RAREFACTION. Recomenda-se o uso das mesmas unidades que encontramos nos bons artigos, para que assim, possamos comparar nossos resultados com outros estudos. E é justamente por isso que a unidade que deveria ser sempre adotada em todos os estudos é o "NÚMERO DE INDIVÍDUOS" (neste caso, no programa PAST, deve-se usar o comando INDIVIDUAL RAREFACTION), mas hoje a "moda" é usar unidades amostrais como unidade do eixo X. Resolvi tua dúvida?
Newton, boa tarde... Estou com essa dificuldade no meu TCC. Já inseri de diversas formas no PAST os dados para a curva de coletor, mais não consigo fazê-la estabilizar... Gostaria de saber como faço para lançar os dados corretamente no PAST e já aparecer a Curva... Sei que é o acúmulo de espécies durante os dias de coleta... Como faço?
Me passa teus dados (só os que servirão para construir a curva) no email bionewton@gmail.com . Outra coisa, caso você tenha gerado a curva mas ela não estabilizou, beleza. Isso quer dizer que você não tem suficiência amostral, desse modo a curva fica com aspecto ascendente.
Enviei os arquivos para você dar uma olhada...
@@bionewton Eu também estou com o mesmo problema do Márcio, fazendo meu TCC com morcegos e nao to conseguindo gerar a curva, você pode me ajudar? grato
Boa tarde Newton Filho, ótima explicação sobre a curva do coletor, porém achei um exercício na internet em que não consegui aplicar na prática, você poderia me mandar seu e-mail para que eu possa te enviar? Desde já agradeço pela atenção. E, obrigado por esse exemplo.
carlos eduardo bionewton@gmail.com se eu puder ajudar
Newton Filho Encaminhei o e-mail. obrigado!
Olá, você poderia me ajudar? amostrei em 3 áreas diferentes e não consigo estabilizar no PAST.
Oi, deixe ver se entendi. Você fez as curvas mas elas estão ascendentes e não apresentam sinal de estabilização? Se esse for o caso, isso indica que você precisa amostrar mais.
Se puder divulgar o script do R ... vai ajudar muito!
Poderia me mandar essa apresentação bruno.ferreirapaiva@gmail.com
Newton, boa tarde! Gostei muito do seu vídeo, mas queria tirar uma dúvida... Eu tenho uma lista secundária de espécies de uma dada região e queria criar uma curva para que eu possa depois comparar com os meus dados de campo e verificar se esses dados de campo estão próximos dos da curva da lista secundária. Acho que vc passou isso e eu não entendi direito, ou eu tô confundindo tudo.