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当成连续剧追了,花一周的睡觉前时间追完这个playlist 😂
老师讲的很好
陈老师,您讲的很好,但是您能换个背景不,总看一个窗帘有点审美疲劳啊
ZH Q 😄
Nanopore 现在才是最长吧, 1.3 Mb 比PacBio 3万 bp要长的多。 单碱基价格测序也便宜的多
陳老師您好,想請問一下為什麼一般的定序方式無法測到有經過修飾的鹼基呢?那為什麼PacBio又可以呢?這裡聽不是很明白。謝謝!
pacbio算是第三代测序了吧?
+sheng juan PacBio是第三代测序。
正确率为何只有87.5%啊?
+sheng juan 根本原因是,Pacific Biosciences的机器,无法直接判断一段时间的同一颜色的荧光,是一个碱基加上去了,还是相连的两个相同的碱基加上去了。为此,只能设一个时间限定,短于这个时间,算一个碱基;长于这个时间限定,算二个碱基;再长,算三个碱基。而一个碱基发出荧光的时间的长度,是一个类似半衰曲线的分布。所以,时间限定的选择,是一个折中的、妥协的选择,87.5%是一个优化点,时间限制设短了,有更多的插入错误,时间限制设长了,有更多的缺失错误。
+David Chen 那这样的话,可以配合illumina一起,或者多做几次,反正速度快哈。
+sheng juan 是的。在实践操作中,许多做De Novo工作的生物信息公司是用PacBio来得到长的框架,用Illumina来校正碱基。
+David Chen 多谢,陈老师加油!
当成连续剧追了,花一周的睡觉前时间追完这个playlist 😂
老师讲的很好
陈老师,您讲的很好,但是您能换个背景不,总看一个窗帘有点审美疲劳啊
ZH Q 😄
Nanopore 现在才是最长吧, 1.3 Mb 比PacBio 3万 bp要长的多。 单碱基价格测序也便宜的多
陳老師您好,想請問一下為什麼一般的定序方式無法測到有經過修飾的鹼基呢?那為什麼PacBio又可以呢?
這裡聽不是很明白。謝謝!
pacbio算是第三代测序了吧?
+sheng juan PacBio是第三代测序。
正确率为何只有87.5%啊?
+sheng juan 根本原因是,Pacific Biosciences的机器,无法直接判断一段时间的同一颜色的荧光,是一个碱基加上去了,还是相连的两个相同的碱基加上去了。为此,只能设一个时间限定,短于这个时间,算一个碱基;长于这个时间限定,算二个碱基;再长,算三个碱基。而一个碱基发出荧光的时间的长度,是一个类似半衰曲线的分布。所以,时间限定的选择,是一个折中的、妥协的选择,87.5%是一个优化点,时间限制设短了,有更多的插入错误,时间限制设长了,有更多的缺失错误。
+David Chen 那这样的话,可以配合illumina一起,或者多做几次,反正速度快哈。
+sheng juan 是的。在实践操作中,许多做De Novo工作的生物信息公司是用PacBio来得到长的框架,用Illumina来校正碱基。
+David Chen 多谢,陈老师加油!