【陈巍学基因】 视频3:Pacific Biosciences Sequencing

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  • Опубликовано: 22 ноя 2024

Комментарии • 13

  • @fionar123
    @fionar123 8 лет назад +2

    当成连续剧追了,花一周的睡觉前时间追完这个playlist 😂

  • @ethanlin3024
    @ethanlin3024 5 лет назад

    老师讲的很好

  • @zhq8682
    @zhq8682 9 лет назад +5

    陈老师,您讲的很好,但是您能换个背景不,总看一个窗帘有点审美疲劳啊

  • @choumagen947
    @choumagen947 6 лет назад +1

    Nanopore 现在才是最长吧, 1.3 Mb 比PacBio 3万 bp要长的多。 单碱基价格测序也便宜的多

  • @doge-coin
    @doge-coin 5 лет назад

    陳老師您好,想請問一下為什麼一般的定序方式無法測到有經過修飾的鹼基呢?那為什麼PacBio又可以呢?
    這裡聽不是很明白。謝謝!

  • @肥羊-y9d
    @肥羊-y9d 9 лет назад

    pacbio算是第三代测序了吧?

    • @davidchen4753
      @davidchen4753  9 лет назад

      +sheng juan PacBio是第三代测序。

  • @肥羊-y9d
    @肥羊-y9d 9 лет назад

    正确率为何只有87.5%啊?

    • @davidchen4753
      @davidchen4753  9 лет назад

      +sheng juan 根本原因是,Pacific Biosciences的机器,无法直接判断一段时间的同一颜色的荧光,是一个碱基加上去了,还是相连的两个相同的碱基加上去了。为此,只能设一个时间限定,短于这个时间,算一个碱基;长于这个时间限定,算二个碱基;再长,算三个碱基。而一个碱基发出荧光的时间的长度,是一个类似半衰曲线的分布。所以,时间限定的选择,是一个折中的、妥协的选择,87.5%是一个优化点,时间限制设短了,有更多的插入错误,时间限制设长了,有更多的缺失错误。

    • @肥羊-y9d
      @肥羊-y9d 9 лет назад

      +David Chen 那这样的话,可以配合illumina一起,或者多做几次,反正速度快哈。

    • @davidchen4753
      @davidchen4753  9 лет назад +1

      +sheng juan 是的。在实践操作中,许多做De Novo工作的生物信息公司是用PacBio来得到长的框架,用Illumina来校正碱基。

    • @肥羊-y9d
      @肥羊-y9d 9 лет назад

      +David Chen 多谢,陈老师加油!