Hola, se elimina para que no interfiera con la secuenciación de la 2a hebra, la compañía illumina vende los kits (soluciones) para cada etapa del proceso, una de las soluciones se emplea para cortar y lavar esa hebra, la composición de esas soluciones está patentada, creo que es una enzima de restricción, que luego se va con el lavado fácilmente y sin problemas porque la 2a hebra está unida a la flow cell.
Hola. La diferencia principal es la cantidad de DNA que puedes secuenciar con una reacción Illumina (millones de pb), a diferencia de la Sanger que cada secuenciación te resulta en 800 pn cuando mucho ruclips.net/video/4lxxhSKgJTI/видео.html
También que puedes secuenciar ADN de diferentes organismos al mismo tiempo (tanto a nivel de gen como genoma completo). Mientras que en sanger se necesita que los fragmentos de ADN sean identicos.
Hola, los adaptadores están pegados en el DNA que se quiere secuenciar, y por lo tanto permiten que los fragmentos se copien durante el "bridge amplification" (ya que tenemos la secuencua complementaria "impresa" en la celda), además son punto de partida para la secuenciación.
@@topicosnucleicos4499 ¿Pero cómo se pegan los adaptadores a nuestro DNA molde? Se supone que uno agrega los adaptadores que supongo que son primers y son complementarios a los oligos que están pegados en la flow cell? O los oligos que están pegados a la flow cell á qué son complementarios, porque se supone qué hay una hibridacion especifica.
@@Andrea-sh9sn Los adaptadores los pegas una vez que tienes el DNA que quieres secuenciar. Es una reacción de ligación normal para formar un enlace fosfodiester. Hay kits provistos con la enzima para este fin
@@topicosnucleicos4499 ok, perfecto. Entonces los adaptadores son secuencias de ADN que ligas a el DNA que se quiere secuenciar? Esos adaptadores son complementarios a los oligos que están en la celda, supongo. Y los índices que sirven de identificador, también amplifican en las reacciones de PCR?
Hola, para ensamblar datos de Illumina se puede usar SPAdes (o al menos es el que usamos en un proyecto en el que estoy) también he visto Soapdenovo v2.04
![Felix "Unfair" | [Stray Kids : SKZ-PLAYER]](http://i.ytimg.com/vi/Oswujxm2Ag0/mqdefault.jpg)
La mejor explicación que vi hasta ahora
¡Excelente ilustración y explicación! Gracias.
Muy bien explicado, muchas gracias! 💗
Excelente explicación. Nuevo sub
Mejor explicado o mejor explicado!! muchas gracias!!
Excente video!
muy buena explicacion!! :D
Muchas gracias por la explicación.
Súper claro!!!
Muchas gracias, muy claro todo!!
Que buena explicación, felicitaciones.
Me ayudo mucho, gracias.
Con mucho gusto
Gracias! Buen video
Gracias por la explicación. Una duda: ¿cómo logran que solo un fragmento se una por cada nano well?
Que buena pregunta. No sé la respuesta. Supongo que por el espacio tan limitado solo puede hibridar una cadena antes del "bridge amplification"
graciassssssss
buen vídeo le agradezco
Porque y como se elimina la primera hebra sintetizada para formar otra? 9:11
Hola, se elimina para que no interfiera con la secuenciación de la 2a hebra, la compañía illumina vende los kits (soluciones) para cada etapa del proceso, una de las soluciones se emplea para cortar y lavar esa hebra, la composición de esas soluciones está patentada, creo que es una enzima de restricción, que luego se va con el lavado fácilmente y sin problemas porque la 2a hebra está unida a la flow cell.
Buen video, un poco lento pero la explicación es buena
Buen video, podrias explicarme cual seria la diferencia entre esta secuenciacion y la de sanger?
Hola. La diferencia principal es la cantidad de DNA que puedes secuenciar con una reacción Illumina (millones de pb), a diferencia de la Sanger que cada secuenciación te resulta en 800 pn cuando mucho ruclips.net/video/4lxxhSKgJTI/видео.html
También que puedes secuenciar ADN de diferentes organismos al mismo tiempo (tanto a nivel de gen como genoma completo). Mientras que en sanger se necesita que los fragmentos de ADN sean identicos.
¿Por qué los fragmentos tienen que ser menores a 600 pb?
¿qué son los adaptadores, para qué sirven, etc? Los índices son los identificadores, pero , para qué son los adaptadores?
Hola, los adaptadores están pegados en el DNA que se quiere secuenciar, y por lo tanto permiten que los fragmentos se copien durante el "bridge amplification" (ya que tenemos la secuencua complementaria "impresa" en la celda), además son punto de partida para la secuenciación.
@@topicosnucleicos4499 ¿Pero cómo se pegan los adaptadores a nuestro DNA molde? Se supone que uno agrega los adaptadores que supongo que son primers y son complementarios a los oligos que están pegados en la flow cell? O los oligos que están pegados a la flow cell á qué son complementarios, porque se supone qué hay una hibridacion especifica.
@@Andrea-sh9sn Los adaptadores los pegas una vez que tienes el DNA que quieres secuenciar. Es una reacción de ligación normal para formar un enlace fosfodiester. Hay kits provistos con la enzima para este fin
@@topicosnucleicos4499 ok, perfecto. Entonces los adaptadores son secuencias de ADN que ligas a el DNA que se quiere secuenciar? Esos adaptadores son complementarios a los oligos que están en la celda, supongo. Y los índices que sirven de identificador, también amplifican en las reacciones de PCR?
Muchas gracias por la información, qué programa se podría usar en la bioinformática para ensamblar una NGS por Ilumina?
Hola, para ensamblar datos de Illumina se puede usar SPAdes (o al menos es el que usamos en un proyecto en el que estoy) también he visto Soapdenovo v2.04
Muchas gracias
Hola. ¿Cómo saber que se pegaron los adaptadores?