How to download raw scRNA-seq data from NCBI using sratoolkit

Поделиться
HTML-код
  • Опубликовано: 9 фев 2025
  • How to download raw scRNA-seq data from NCBI using sratoolkit

Комментарии • 3

  • @mandarinclub4675
    @mandarinclub4675 4 месяца назад +1

    Thanks for your video, I was able to run it following your demonstration.

  • @qhawenid
    @qhawenid 4 месяца назад +3

    please continue to demonstrate how to create spliced/ unspliced data / loom files🙏

  • @mikhailolferiev7906
    @mikhailolferiev7906 2 месяца назад

    How to split them and rename into reads and technical runs?

Следующие
Автовоспроизведение
Download and Install Cell Ranger9:47Download and Install Cell Ranger
Download and Install Cell RangerSingle Cell Genomics, Transcriptomics & Proteomics
Просмотров 250
Cell-cell Communication Analysis：How to use the Liana package19:44Cell-cell Communication Analysis：How to use the Liana package
Cell-cell Communication Analysis：How to use the Liana packageSingle Cell Genomics, Transcriptomics & Proteomics
Просмотров 601
Microbiome Data Analysis in R--Video 2: Prepare otu_table from raw fastq files11:42Microbiome Data Analysis in R--Video 2: Prepare otu_table from raw fastq files
Microbiome Data Analysis in R--Video 2: Prepare otu_table from raw fastq filesSingle Cell Genomics, Transcriptomics & Proteomics
Просмотров 377
These Are The Worst Job Interviews Ever34:19These Are The Worst Job Interviews Ever
These Are The Worst Job Interviews EverSMii7Yplays
Просмотров 430 тыс.
Hollywood - Peso Pluma, Estevan Plazola (Video Oficial)04:49Hollywood - Peso Pluma, Estevan Plazola (Video Oficial)
Hollywood - Peso Pluma, Estevan Plazola (Video Oficial)Peso Pluma
Просмотров 4,1 млн
AMAD WORLD CLASS! MAN CITY 1-2 MAN UTD GOLDBRIDGE MATCH REACTION36:09AMAD WORLD CLASS! MAN CITY 1-2 MAN UTD GOLDBRIDGE MATCH REACTION
AMAD WORLD CLASS! MAN CITY 1-2 MAN UTD GOLDBRIDGE MATCH REACTIONThe United Stand
Просмотров 560 тыс.
Timothée Chalamet | This Past Weekend w/ Theo Von #5511:26:35Timothée Chalamet | This Past Weekend w/ Theo Von #551
Timothée Chalamet | This Past Weekend w/ Theo Von #551Theo Von
Просмотров 2 млн
Recreate Seurat Cell Clusters from Xenium Onboard Analysis12:47Recreate Seurat Cell Clusters from Xenium Onboard Analysis
Recreate Seurat Cell Clusters from Xenium Onboard AnalysisSingle Cell Genomics, Transcriptomics & Proteomics
Просмотров 636
How I Parse 99% of PDFs into Structured Data27:59How I Parse 99% of PDFs into Structured Data
How I Parse 99% of PDFs into Structured DataAI Rachid
Просмотров 10 тыс.
Analyzing Gene Sequence Results with BLAST8:24Analyzing Gene Sequence Results with BLAST
Analyzing Gene Sequence Results with BLASTCatalyst University
Просмотров 196 тыс.
Multiple Sequence Alignment9:49Multiple Sequence Alignment
Multiple Sequence AlignmentBob Lessick
Просмотров 173 тыс.
Spatial Data Analysis In QuPath:How to Perform Multiplexed Analysis using Simple Thresholding Method16:18Spatial Data Analysis In QuPath:How to Perform Multiplexed Analysis using Simple Thresholding Method
Spatial Data Analysis In QuPath:How to Perform Multiplexed Analysis using Simple Thresholding MethodSingle Cell Genomics, Transcriptomics & Proteomics
Просмотров 297
Analzye Visium High Definition Spatial Dataset with Seurat16:53Analzye Visium High Definition Spatial Dataset with Seurat
Analzye Visium High Definition Spatial Dataset with SeuratSingle Cell Genomics, Transcriptomics & Proteomics
Просмотров 2 тыс.
What if all the world's biggest problems have the same solution?24:52What if all the world's biggest problems have the same solution?
What if all the world's biggest problems have the same solution?Veritasium
Просмотров 334 тыс.
Primer designing for real time PCR using NCBI Primer Blast9:41Primer designing for real time PCR using NCBI Primer Blast
Primer designing for real time PCR using NCBI Primer BlastBio-Resource
Просмотров 179 тыс.
IEM KATOWICE 2025 GRAND FINAL BO54:18:23IEM KATOWICE 2025 GRAND FINAL BO5
IEM KATOWICE 2025 GRAND FINAL BO5SL4M & Counter-Strike
Просмотров 486 тыс.
С Максимом Шевченко. Распад реальности: Трамп, Россия, Палестина. 09.02.251:19:06С Максимом Шевченко. Распад реальности: Трамп, Россия, Палестина. 09.02.25
С Максимом Шевченко. Распад реальности: Трамп, Россия, Палестина. 09.02.25Максим Шевченко
Просмотров 178 тыс.
Самодельный спорткар уже дымит колесами и наезжает на создателя58:58Самодельный спорткар уже дымит колесами и наезжает на создателя
Самодельный спорткар уже дымит колесами и наезжает на создателяИгорь Негода
Просмотров 125 тыс.
Day 2 | IEM Katowice 2025 Playoffs | 🎙КРИВОЙ ЭФИР6:35:20Day 2 | IEM Katowice 2025 Playoffs | 🎙КРИВОЙ ЭФИР
Day 2 | IEM Katowice 2025 Playoffs | 🎙КРИВОЙ ЭФИРSL4M & Counter-Strike
Просмотров 503 тыс.
ХАХАХА РЕБЯТА МЕНЯ БОИТСЯ СМЕЛОСТЬ?? #машмилаш00:37ХАХАХА РЕБЯТА МЕНЯ БОИТСЯ СМЕЛОСТЬ?? #машмилаш
ХАХАХА РЕБЯТА МЕНЯ БОИТСЯ СМЕЛОСТЬ?? #машмилашМАШ МИЛАШ
Просмотров 710 тыс.
SHARK PUPPET GETS HUGE! (GLOWUP)00:16SHARK PUPPET GETS HUGE! (GLOWUP)
SHARK PUPPET GETS HUGE! (GLOWUP)Shark Puppet
Просмотров 6 млн
НУЖЕН ТОП1 В БИТВЕ БЛОГЕРОВ. День 36:02:46НУЖЕН ТОП1 В БИТВЕ БЛОГЕРОВ. День 3
НУЖЕН ТОП1 В БИТВЕ БЛОГЕРОВ. День 3LeBwa
Просмотров 126 тыс.
Lifehack 😄 ​⁠@Infamous_wu13 #elsarca #tiktok00:13Lifehack 😄 ​⁠@Infamous_wu13 #elsarca #tiktok
Lifehack 😄 ​⁠@Infamous_wu13 #elsarca #tiktokElsa Arca
Просмотров 3,5 млн