Démonstration: Comment utiliser BLAST Ring Image Generator (BRIG) (David Couvin)

Dans cette démonstration, nous allons voir comment utiliser le logiciel BLAST Ring Image Generator (BRIG), un outil de visualisation pour la comparaison de séquences génomiques. Ce logiciel écrit en langage Java est disponible via ce lien : brig.sourceforg.... La publication correspondant à BRIG est aussi librement disponible (doi.org/10.118.... Les séquences plasmidiques utilisées dans la vidéo, font partie du travail de thèse de Gaëlle Gruel (encadrée par Sébastien Breurec).
Note : Veuillez noter que dans cette présentation, j'ai oublié de rajouter les données correspondant au "GC Skew" (pour ce faire, il fallait également sélectionner "GC Skew" et appuyer sur le bouton "Add data" à l'étape montrée au temps 06:22 de la vidéo). Un exemple de figure avec le GC Skew est disponible en ligne dans la publication suivante de Guyomard-Rabenirina et al., 2020 : doi.org/10.338...