KaruBioNet Channel
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Résistance aux antimicrobiens et routes de transmission (Degrâce Batantou)
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Lors de cette réunion KaruBioNet, Degrâce Batantou nous présente son projet de thèse de doctorat : "Résistance aux antimicrobiens et routes de transmission : De l'environnement hospitalier vers le milieu naturel"
CRISPRCasFinder, a script allowing to identify CRISPR arrays and associated cas genes (David Couvin)
Просмотров 1312 часов назад
Lors de cette démonstration, David Couvin nous présente l'outil CRISPRCasFinder. Publication : Couvin D, Bernheim A, Toffano-Nioche C, Touchon M, Michalik J, Néron B, Rocha EPC, Vergnaud G, Gautheret D, Pourcel C. CRISPRCasFinder, an update of CRISPRFinder, includes a portable version, enhanced performance and integrates search for Cas proteins. Nucleic Acids Res. 2018 Jul 2;46(W1):W246-W251. d...
Rôle des micro-ARNs sécrétés dans les interactions plantes-microbiotes (Emmanuel Clostres)
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Lors de cette réunion KaruBioNet du jeudi 22 février 2024, Emmanuel Clostres, a réalisé la présentation suivante : "Rôle des micro-ARNs sécrétés dans les interactions entre les plantes et leurs microbiotes" Lien vers la publication associée : doi.org/10.21203/rs.3.rs-3363027/v1
Chlordecone from plantations to population: usage in the French Caribbean islands (Geraldine Vilmen)
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Lors de cette réunion KaruBioNet du jeudi 22 février 2024, Géraldine Vilmen (NIH/NCI), a réalisé la présentation suivante : "Chlordecone from plantations to population: usage in the French Caribbean islands and consequences on health"
Phylogenetic Investigations of Dengue 2019-2021 Outbreak in Guadeloupe and Martinique (Margot)
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Lors de cette réunion KaruBioNet du jeudi 12 octobre 2023, Margot Garcia Van Smévoorde (IPG), a réalisé la présentation suivante : " Phylogenetic Investigations of Dengue 2019-2021 Outbreak in Guadeloupe and Martinique Caribbean Islands " Ce travail a récemment été publié dans le journal Pathogens (doi.org/10.3390/pathogens12091182)
Simulation-Based Reasoning of DNA Double Strand Break Using Abduction ... (Andrei Doncescu)
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Une conférence "grand public" a eu lieu en local (Pointe-à-Pitre), le mardi 27 juin 2023, lors de la conférence JOBIM (édition 2023 ; jobim2023.sciencesconf.org/). Nous avons pu assister à la présentation de Pr. Andrei Doncescu (UA), intitulée : "Simulation-Based Reasoning of DNA Double Strand Break Using Abduction from Default Logic".
Intelligence Artificielle au service de la santé: prévention, diagnostic&thérapeutique(Jimmy Siméon)
Просмотров 94Год назад
Une conférence "grand public" a eu lieu en local (Pointe-à-Pitre), le mardi 27 juin 2023, lors de la conférence JOBIM (édition 2023 ; jobim2023.sciencesconf.org/). Nous avons pu assister à la présentation de M. Jimmy Siméon (CHUG), intitulée : "L’intelligence Artificielle au service de la santé : prévention, diagnostic et thérapeutique".
Traitement des pollutions par les pesticides (Sarra Gaspard)
Просмотров 46Год назад
Une conférence "grand public" a eu lieu en local (Pointe-à-Pitre), le mardi 27 juin 2023, lors de la conférence JOBIM (édition 2023 ; jobim2023.sciencesconf.org/). Nous avons pu assister à la présentation du Pr. Sarra Gaspard (UA), intitulée : "Traitement des pollutions par les pesticides".
Variabilité naturelle des communautés bactériennes ... (Lyza Hery)
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Une conférence "grand public" a eu lieu en local (Pointe-à-Pitre), le mardi 27 juin 2023, lors de la conférence JOBIM (édition 2023 ; jobim2023.sciencesconf.org/). Nous avons pu assister à la présentation du Dr. Lyza Héry, intitulée : "Variabilité naturelle des communautés bactériennes et des propriétés physicochimiques des gîtes et leur influence sur le microbiote bactérien d'Aedes aegypti".
Insights into arbovirus genomicsthrough One-Health approaches (Sylvie Lecollinet)
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Une conférence "grand public" a eu lieu en local (Pointe-à-Pitre), le mardi 27 juin 2023, lors de la conférence JOBIM (édition 2023 ; jobim2023.sciencesconf.org/). Nous avons pu assister à la présentation du Dr. Sylvie Lecollinet (CIRAD), intitulée : "Insights into arbovirus genomicsthrough One-Health approaches".
Thiomargarita magnifica, la bactérie géante des mangroves de bord de mer (Olivier Gros)
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Une conférence "grand public" a eu lieu en local (Pointe-à-Pitre), le mardi 27 juin 2023, lors de la conférence JOBIM (édition 2023 ; jobim2023.sciencesconf.org/). Nous avons pu assister à la présentation du Pr. Olivier Gros (UA), intitulée : "Thiomargarita magnifica, la bactérie géante des mangroves de bord de mer qui repousse les limites de la bactériologie".
Le C3I, plateforme commune de calcul intensif, de bioinformatique (Pascal Poullet)
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Une conférence "grand public" a eu lieu en local (Pointe-à-Pitre), le mardi 27 juin 2023, lors de la conférence JOBIM (édition 2023 ; jobim2023.sciencesconf.org/). Nous avons pu assister à la présentation du Pr. Pascal Poullet (UA), intitulée : "Le Centre Commun de Calcul Intensif (C3I), plateforme commune de calcul intensif, de bioinformatique". Lien vers le C3I : calamar.univ-ag.fr/c3i/
Prototheca sp. - a tale of a peculiar pathogen (Tomasz Jagielski)
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During his visit to the Institut Pasteur de la Guadeloupe (June 1, 2023), Tomasz Jagielski (Department of Medical Microbiology, University of Warsaw) made the following presentation: "Prototheca sp. - a tale of a peculiar pathogen"
Les habitats comme déterminants de la diversité virale chez 7 espèces de rongeurs -Sourakhata Tirera
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Lors de cette réunion KaruBioNet du mardi 04 avril 2023, Sourakhata Tirera (Institut Pasteur de la Guyane) a réalisé la présentation suivante : "Les habitats comme déterminants de la diversité virale chez sept espèces de rongeurs néotropicaux" Auteurs : Sourakhata Tirera, Damien Donato, Christiane Bouchier, Vincent Lacoste, Benoit de Thoisy, Alain Franc, and Anne Lavergne. Résumé : Les rongeurs...
Epidemiology of yam viruses in Guadeloupe: role of cropping practices and seed-tuber supply (Boucar)
Просмотров 652 года назад
Epidemiology of yam viruses in Guadeloupe: role of cropping practices and seed-tuber supply (Boucar)
Formation RNAseq et ligne de commandes (Alice Choury, Vincent Guerlais, Raphaël Pasquier)
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Les graphes au service de la biologie : modélisation et applications (1ère partie) (Stephane Cholet)
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Modèle de cartographie de la pollution historique par les pesticides (Victor Dufleit)
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Covid-19 une pandémie d'une nouvelle ère (Géraldine Vilmen)
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Greentech, lowtech, quand l'industrie du logiciel repense les R&D +écolos +sécurisés (Betty Fausta)
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Greentech, lowtech, quand l'industrie du logiciel repense les R&D écolos sécurisés (Betty Fausta)
Démonstration: Comment utiliser BLAST Ring Image Generator (BRIG) (David Couvin)
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Analyse spatiale de l'incidence des cancers par une méthode bayésienne (Bernard Bhakkan)
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Présentation rapide de Galaxy KaruBioNet
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Présentation: Expression différentielle chez Sus scrofa (Alice Choury)
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Formation Galaxy (Atelier analyse comparative de génomes bactériens)
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Formation Galaxy (quelques exemples d'analyses)
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Formation Galaxy (Metabarcoding avec FROGS)
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Formation Galaxy (Galaxy 101)
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Démonstration: Machines virtuelles (Damien Cazenave)
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