Olá professor, seria interessante vc fazer vídeos mostrando como utilizar o Bioedit, por exemplo: mostrando o que dá pra fazer nele, o que faz naquelas abas que tem lá.
muito obrigada pelo vídeo, super didático... tenho uma pergunta, nas minhas análises não consegui encontrar fragmentos parecidos, como no vídeo, e eram F e R.. o que pode ser?
Olá Emily! As vezes as sequências vem no mesmo padrão de leitura e você precisa fazer o reverso complemento! Mas já aconteceu de aparecer partes de sequência diferentes e eram produtos de contaminação.....precisa averiguar se isso ocorre em todas ou algumas amostras!
Olá, existe sim! Você pode baixar sequências do GenBank e treinar. Tente baixar sequências do COI de alguns animais. Tente buscar pelo nome científico e COI. Obrigado pela atenção!
Quando vc não consegue o alimento, significa que o sequenciamento do Forward e reverse não foi adequado ou teve uma qualidade abaixo do esperado. O indicado é refazer o sequenciamento. Abraço.
@@luanacerqueira8435 ah sim! Alguns procedem dessa forma para não perder o que já foi sequenciado! Depende tb dos objetivos! Se a intenção é fazer filogenia a diminuição da sequência inevitavelmente perderá informações valiosas que podem afetar o resultado final. Há tb o problema do dinheiro tb para sequenciar, que muitas vezes impede o aluno de refazer o sequenciamento. Mas é possível sim!
@@luanacerqueira8435 Sua intenção é Barcode? Se sim, você deve se atentar ao número de nucleotídeos do COI. No trabalho do Hebert et al. 2003 ele dá um número exato que devemos nos atentar para fazer a identificação. Tome cuidado! Quando eu fiz em formigas houve variação superior aos 2% estabelecidos, mas provavelmente isso ocorreu devido à mutações não sinônimas. Caso tenha um número abaixo do estabelecido pelos autores você não vai ter certeza na identificação, apenas uma probabilidade. Boa sorte!
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Amei a explicação, irá me ajudar muito ❤
Olá professor, seria interessante vc fazer vídeos mostrando como utilizar o Bioedit, por exemplo: mostrando o que dá pra fazer nele, o que faz naquelas abas que tem lá.
Olá! Conheço algumas funções específicas do Bioedit, mas infelizmente não todas! Vou ver o que posso fazer! Obrigado pela atenção.
Trabalho feito com excelência! Parabéns!!
Obrigado! Grande abraço
Oi Sor, vídeo muito bom :D
muito obrigada pelo vídeo, super didático... tenho uma pergunta, nas minhas análises não consegui encontrar fragmentos parecidos, como no vídeo, e eram F e R.. o que pode ser?
Olá Emily! As vezes as sequências vem no mesmo padrão de leitura e você precisa fazer o reverso complemento! Mas já aconteceu de aparecer partes de sequência diferentes e eram produtos de contaminação.....precisa averiguar se isso ocorre em todas ou algumas amostras!
existem sequências em que eu posso treinar esse processo?
Olá, existe sim! Você pode baixar sequências do GenBank e treinar. Tente baixar sequências do COI de alguns animais. Tente buscar pelo nome científico e COI. Obrigado pela atenção!
E quando as sequencias não se alinham para formar o contig???
Quando vc não consegue o alimento, significa que o sequenciamento do Forward e reverse não foi adequado ou teve uma qualidade abaixo do esperado. O indicado é refazer o sequenciamento. Abraço.
@@tutoriaisbiomol2167 É recomendado fazer a leitura do seuenciamento de apenas um dos primers??
Alguns pesquisadores procedem dessa forma.
@@luanacerqueira8435 ah sim! Alguns procedem dessa forma para não perder o que já foi sequenciado! Depende tb dos objetivos! Se a intenção é fazer filogenia a diminuição da sequência inevitavelmente perderá informações valiosas que podem afetar o resultado final. Há tb o problema do dinheiro tb para sequenciar, que muitas vezes impede o aluno de refazer o sequenciamento. Mas é possível sim!
O objetivo é apenas identificação a nível de gênero, e se possível de espécie
@@luanacerqueira8435 Sua intenção é Barcode? Se sim, você deve se atentar ao número de nucleotídeos do COI. No trabalho do Hebert et al. 2003 ele dá um número exato que devemos nos atentar para fazer a identificação. Tome cuidado! Quando eu fiz em formigas houve variação superior aos 2% estabelecidos, mas provavelmente isso ocorreu devido à mutações não sinônimas. Caso tenha um número abaixo do estabelecido pelos autores você não vai ter certeza na identificação, apenas uma probabilidade. Boa sorte!