Cuando uses software libre no esperes cosas tan especializadas que no es común. Muchas veces uso R para solventar los ""problemas"" de QGIS. En lo personal, R tiene más capacidad, pero es muy tardado programar todas las líneas de código, por eso uso QGIS en esos casos. Cuando son procesos tan especializados como los que mencionas, puedes extraer el proceso en Python y lo puedes hacer en el entorno de programación directamente, eso también puede funcionar.
Cuando uses software libre no esperes cosas tan especializadas que no es común. Muchas veces uso R para solventar los ""problemas"" de QGIS. En lo personal, R tiene más capacidad, pero es muy tardado programar todas las líneas de código, por eso uso QGIS en esos casos. Cuando son procesos tan especializados como los que mencionas, puedes extraer el proceso en Python y lo puedes hacer en el entorno de programación directamente, eso también puede funcionar.