Thầy ơi cho em hỏi là em muốn tìm trình tự mẫu để sao sánh với trình tự đã giải thì làm như thế nào với tải trình tự mẫu đuôi ab1 thì làm sao ạ
3 года назад
Đuôi đó là file nhận được sau khi giải trình tự. E nhận dc 2 file là ab1 và seq. E mở file seq lên nhé. Để tìm trình tự tương đồng e dùng chương trình BLAST của ncbi nhé
@ Dạ, em lấy file đó để xem được dạng đồ thị gen trong so sánh mất điểm nu bị mất. Em tìm mãi không thấy. Chỉ thấy trên video thầy có đề cập đến file đó mà chưa được rõ lắm. Nên em mới bình luận vào ạ
2 года назад+1
Đúng r. Trong chỉnh sửa trình tự thì nên xem file ab1. Còn so sánh gen thì e dùng blast trên NCBI để tìm các trình tự tương ứng
Chào thầy, cảm ơn vì video rất bổ ích cho những người mới học như em. Thầy cho em hỏi là khi xử lý và sắp xếp xong các trình tự. Muốn lưu file đó về dạng đuôi DMXS để hôm sau muốn tiếp tục thực hiện trên các trình tự đó chỉ cần mở file đó ra thì làm ntn ạ?
3 года назад
Mình chưa hiểu câu hỏi lắm. Bạn có thể viết rõ hơn được không? Nếu đang xử lý vẫn lưu file được mà. Đuôi khác em ạ
Anh ơi làm sao để hiện số liệu bootstrap ạ. Em cảm ơn
5 лет назад
Để hiện số bootstrap, em phải xây dựng cây phân loại theo nó. Sau khi bấm vào xây dựng cây phân loại, em chọn test of Phylogeny là bootstrap, chọn 100 hoặc 1000 (tùy em, số to máy xử lý lâu hơn). Chúc em thành công!
em muốn hỏi có bài nào Thầy dạy về tìm kiếm vùng bảo tồn gene ko ạ
Thày chưa, nếu em cần có thể trao đổi vs th qua zl nhé
Em đã xem, và vô cùng dễ hiểu. Cảm ơn thầy!
Nhật Hà Chu nếu có gì khó khăn thì trao đổi nhe. Thầy mới nghiên cứu thôi em ạ
Thầy ơi cho em hỏi là em muốn tìm trình tự mẫu để sao sánh với trình tự đã giải thì làm như thế nào với tải trình tự mẫu đuôi ab1 thì làm sao ạ
Đuôi đó là file nhận được sau khi giải trình tự. E nhận dc 2 file là ab1 và seq. E mở file seq lên nhé. Để tìm trình tự tương đồng e dùng chương trình BLAST của ncbi nhé
@ dạ em cảm ơn nhiều ạ
Thầy ơi. muốn vẽ thanh scale mà không được nó luôn bị ẩn. Thầy chỉ giúp em với
Mình không hiểu ý bạn nói như thế nào? Bạn giải thích rõ hơn dc k?
Chào thầy. Cho em hỏi khi sơ đồ cây của e bị cắt, không full hình ảnh thì bị lỗi gì vậy ạ? Và khắc phục như thế nào ạ? Em cảm ơn
Mình muốn xóa 1 nhánh của cây phát sinh thì phải làm như nào ạ? Cảm ơn thầy ạ!
Bạn xem ở nhánh đó có những mẫu nào rồi xoá từ file đầu rồi chạy lại thôi. Nếu k đc ib vào zl mình hướng dẫn. Chúc bạn thành công!
@ em đã gửi mail cho thầy vì không tìm được tài khoản zalo của thầy ạ. Mong thầy giúp đỡ em cảm ơn!
Thầy ơi! Em không biết làm sao để có file .ab1 tương ứng. Thầy có thể chỉ em biết không?
File đuôi ab1 là định dạng của file xuất giải trình tự. Em lấy file đó làm gì?
@ Dạ, em lấy file đó để xem được dạng đồ thị gen trong so sánh mất điểm nu bị mất. Em tìm mãi không thấy. Chỉ thấy trên video thầy có đề cập đến file đó mà chưa được rõ lắm. Nên em mới bình luận vào ạ
Đúng r.
Trong chỉnh sửa trình tự thì nên xem file ab1.
Còn so sánh gen thì e dùng blast trên NCBI để tìm các trình tự tương ứng
@ Dạ, em đã hiểu ý thầy rồi. Em cảm ơn thầy
Chúc em học tốt!
Chào thầy, cảm ơn vì video rất bổ ích cho những người mới học như em. Thầy cho em hỏi là khi xử lý và sắp xếp xong các trình tự. Muốn lưu file đó về dạng đuôi DMXS để hôm sau muốn tiếp tục thực hiện trên các trình tự đó chỉ cần mở file đó ra thì làm ntn ạ?
Mình chưa hiểu câu hỏi lắm. Bạn có thể viết rõ hơn được không?
Nếu đang xử lý vẫn lưu file được mà. Đuôi khác em ạ
Video rất hữu dụng ạ. Em cảm ơn thầy
Cho em hỏi có cách nào xuất được file alignment ra file text không ạ?
Nghĩa là sau khi alignment, em muốn xuất ra file txt à hay như thế nào? Mình chưa hiểu mục đích của em lắm.
Cảm ơn thầy nhé! Nếu muốn hiển thị thanh chuẩn của cây phân loại thì vào chỗ nào thầy ơi?
Anh ơi làm sao để hiện số liệu bootstrap ạ. Em cảm ơn
Để hiện số bootstrap, em phải xây dựng cây phân loại theo nó. Sau khi bấm vào xây dựng cây phân loại, em chọn test of Phylogeny là bootstrap, chọn 100 hoặc 1000 (tùy em, số to máy xử lý lâu hơn).
Chúc em thành công!