ممنون از لطف و کامنت شما. خوشحالم که شما اینطور فکر میکنید و البته این ویدیو بسیار عمومی هست و بیشتر در جهت اهمیت موضوع و آشنایی با کلیات بود. امیدوارم که شما تو این مسیر بسیار با ارزش مهم به خوبی جلو برید و بهترین نتایج ممکن رو بگیرید. 🌹🙏🏻🌺🌺
ممنونم بابت این ویدیو بسیار مفید. بنده هم بعد از آشنایی با شما خیلی بیشتر این نیاز رو در خودم حس کردم که باید این آنالیز هارو یاد بگیرم واقعا کمک بزرگی به بچه ها میکنین 🌹
قربانت عزیز و ما کاری نکردیم. طبیعتا موضوعات نیازهای فیلد و رشته های ما هستن و ما هم داریم سعی میکنیم هر روز اپدیت باشیم واستفاده کنیم و درکنارش با تو و بقیه بچه ها هم همفکری کنیم. سپاس مجدد از کامنتت 🌹🌹
در تکمیل فرمایشاتتون برای اشنایی بچه ها با انالیز های GO که بعد از انالیز های RNA-seq انجام میشه از این دیتابیس ها میشه استفاده کرد امیدوارم برای بچه ها مفید باشه: DAVID, rEnrich, Panther,genemania
ممنون علیرضا عزیز از کامنت و توضیحت. البته این ویب سایت ها یا وب تولز ها محدود به دیتای ار ان ای سک نیستن و برای هر لیستی از ژن ها کاربرد دارن. تعداد این وب تولز ها خیلی خیلی زیاد هستش ولی اگه بخوام دوتا اضافه کنم توضیه میکنم از Gene set enrichment analysis (GSEA) and gProfiler استفاده بشه. البته خیلی بسته به نوع انالیز هم هست مثل همین کار تو شبکه ها میشه با BiNGO, ClueGO, CluePedia etc. استفاده کردن. خوشبختانه یادگیری این ها خیلی راحت و هرکدم شاید چند دقیقه وقت بخوان.
سلام وقتتون بخیر. از بین این همه روش های و تکنولوژی هایی که برای سینگل سل وجود دارند (منظورم روش های بدست آوردن ماتریکس هستش) کدوم رو یاد بگیریم آیا لازمه مزایا یا معایب هر کدمو یاد بگیریم؟
با تشکر از تولید محتوای خوبتون میخواستم بپرسم در کانادا دانشجو های بیولوژی در دوره لیسانس چه مهارت هایی رو یاد میگیرین ؟ من میخوام برای ارشد اپلای کنم اما به دلیل اموزش انلاین از نظر عملی هیچی بلد نیستم خواستم بدونم چه دوره هایی رو باید خارج از دانشگاه شرکت کنم ممنون❤❤
سلام و عرض ادب و ببخشید از تاخیر در جواب دادن. اینجا معمولا دانشجوهای لیسانس می تونن از روش های مختلف و به عنوان های مختلف وارد ازمایشگاه بشن و هر دانشجو بسته به ازمایشگاهی که میره و بک گراند و وقتی که میذاری چیزهایی یاد میگیره و اینطور نیست همه اون ها یک سری تکنیک یا روش مشخص یاد بگیرن. خیلی ها اینجا دنبال یاد گرفتن انالیز دیتا میرن و ماهم وقتی ایران بودیم از اواخر لیسانس این کار رو انجام دادیم و سی وی خوبی برای ما شد. دوره ها به معنی یادگرفتن نیستن و من توصیه نمیکنم زیاد پولی از این بابت هزینه کنید ولی بابت آشنایی اگه کیفیت خوبی داشته باشن می تونن مفید باشن. زنده باشی شما🌹🌹❤❤
خیلی ممنون ک تجربیاتتون رو ب اشتراک میزارید.برای بیوانفورماتیک و computational biology بهتره از رشته های تجربی مث بیوتک وارد شیم یا رشته هایی مث مهندسی نرم افزار ؟ (من رشته تجربی بودم و امسال قراره کنکور تجربی بدم در دانشگاه سراسری ن اما دانشگاه غیرانتفاعی می تونم رشته مهندسی کامپیوتر(نرم افزار) بخونم و با تحقیقی ک کردم و جیزهایی ک شما گفتید فکمی کنم با مهندسی کامپیوتر شانس بیشتری برای کار دارم هم تو حوزه زیست شناسی هم بطور کلی) ممنون میشم راهنماییم کنید
خیلی ممنون از توضیحات کاملتون 🙏🏻 من فقط یک سوال دارم افرادی که هنوز تو هیچ آزمایشگاه یا شرکتی فعالیت نمیکنند و به دیتا های واقعی دسترسی ندارند ، برای تمرین و یادگیری تکنیک های انالیز دیتا ، از کجا دیتا بیارن ؟
سلام و عرض ادب. قربان شما و ممنون از کامنت شما. اصلا نیازی نیست شما تو پروژه ای باشید یا کار ازمایشگاهی کنید. صدها منبع برای این دیتاها وجود دارن که دوتا از مشهور ترین هاش NCBI-GEO EBI- ArrayExpress هستن که تو این ها میلیون ها سمپل وجود دارن برای انالیز. تقریبا این روزا هر مقاله ای با دیتاهای سیکونسینگ چاپ میشن باید دیتا رو رایگان در دسترس بقیه قرار بدن و این دو منبع بیشترین جاهایی هستن که نمونه اپلود میشن. البته لیست این منابع زیاد ولی فک کنم این دو برای شروع خیلی کافی و عالی باشن.
سلام ممنون از اقای شکور و اقای معین و نیوشا خانم برای تهیه این ویدیوی با ارزش. این پکیج سیرت که معرفی کردین بر اساس زبان آر هست ولی من پایتون بلدم. روشی یا پکیج دیگه ای هست بر اساس پایتون باشه؟
سلام و عرض ادب.. شما خیلی لطف دارید. معین چند بار جواب کامنت شما رو داد ولی نمیدانم چرا حذف میشه تو یوتیوب. یقینا روش های زیادی برای پایتون هم وجود دارن. من جواب معین رو همین زیر برای شما میذارم Salam, khahesh mikonam, man khodam ba Python analyze nakardam vali package Scanpy khoobe baraye kar kardan اینم هم لینک scanpy.readthedocs.io/en/stable/
@@zahramohammadi413 ببخشید متاسفانه یوتیوب انگار با کامنت هایی که از ایران میان مشکل داره و متاسفانه من اینجا لینکی نمی بینم. فقط موقعی که نوتیفیکشن پیام اولیه شما امد دیدم تو نوتیفیکیشن یه لینک هست از موسسه مکت خونه. واقعیتش من این موسسه رو نمیشناسم. شخصا هیچوقت ورک شاپ پولی نرفتم و البته تو ایران هیچ ورک شاپی شرکت نکردم. اون ورک شاپ هایی رو هم که شخصا می شناختم افرادش رو کیفیت بالایی نداشتن ولی متاسفانه اصلا با این مرکز و کارها اشنایی ندارم. نهایتا برای یادگیری منبع رایگان با کیفیت زیاد هستش و بیشتر از منبع صبر و تداوم نقش بازی میکنه.
@@BioCanApply بله برای منم پاک میشه. نه این دوره رایگانه و اساتیدش هم اساتید دانشگاه شریف و تهران هستند. حالا اگه دوستان خواستن میتونن استفاده کنن. بله این که واقعا باید وقت گذاشت و چیزی جای تمرین رو نمیگیره ولی خب استاد خوب خیلی زودتر ادمو به نتیجه میرسونه. ممنونم از پاسختون
@@zahramohammadi413 بله درست میگید و من اخیرا شنیدم دوره های این مرکز رایگان هستن و طبیعتا رایگان بودن نشان قصد مثبت داره و امیدوارم خیلی عالی باش و بچه ها استفاده کنن. من خودم ندیدم و نمی تونم نظر بدم ولی به طبع هر دوره ای می تون نکات مفیدی داشته باش. یقینا وجود اطلاعات خیلی می تونه مفید باش و الگوی یادگیری افراد هم متفاوت هستش بعضی ها تو کلاس و با توضیح بهتر یاد میگیرن و بعضی ها با کلاس میانه خوبی ندارن. ممنون از بابت توضیح و خیلی عالی هستش که دوره های رایگان وجود دارن.
ممنونم از هر سه نفر شما بابت زمانی که گذاشتید بسیار مفید و با ارزش بود
نیوشا، معین و من هم از کامنت شما ممنونیم و خوشحالیم که شما اینطور فکر میکنید.
با آرزوی موفقیت و سلامتی شما.
ممنونم از سه بزرگوار گرامی. تمامی مطالب برایمن نوعی که نوآموز این حیطه هستم، کاربردی و جامع بود. تشکر فراوان 🌹🙏🏻🌺
ممنون از لطف و کامنت شما. خوشحالم که شما اینطور فکر میکنید و البته این ویدیو بسیار عمومی هست و بیشتر در جهت اهمیت موضوع و آشنایی با کلیات بود. امیدوارم که شما تو این مسیر بسیار با ارزش مهم به خوبی جلو برید و بهترین نتایج ممکن رو بگیرید.
🌹🙏🏻🌺🌺
بازم ممنون از شما و آقا معین و نیوشا خانم،بسیار ویدئو آموزنده ای هست و من به شخصه از این توضیحات استفاده خواهم کرد.
سپاس از لطف شما و ما همه خوشحالیم شما اینطور فکر میکنید. زنده و موفق باشید در کنار سلامتی🙏💐🙏
Kheili awli, karbordi va ghabele fahm bood👍🏻 Kheili mamnon az shoma, aghaye moein va Niusha🙏🏻🌷👍🏻
سلام و عرض ادب و ممنونم. خوشحالم که برای شما کمی مفید بود و یقینا این نیوشا و معین رو هم خیلی خوشحال میکنه.
🙏🏻🌷👍🏻 :)
خیلی عالی و مفید دست هر 3 تاتون درد نکنه
ممنون از کامنت و خوشحالم مفید بود. زنده باشید 🌹🌹🌹
ممنون از زحماتتون بابت تهیه این ویدیو، مطالب عالی بودو دید خیلی خوبی به آدم میده
زنده باشی شما. خیلی خوشحالم اینطور فکر میکنید. انجام وظیه ست🙏🌷🙏
درود بر شما شکور جان لطف بزرگی کردید.
درود بر شما و سپاس از حمایت همیشگی شما.زنده باشید و امیدوارم خبرای خوب به ما بدین به زودی🌷👍🌹🙏
خیلی ممنون از هر سه نفر بابت لطف و وقتی که گذاشتید. امیدوارم همیشه موفق باشید.
قربان شما و انجام وظیفه بود. ممنون از حمایت شما و به امید موفقیت و شادی شما.
عالی
سپاس از شما و زنده باشید.🙏🌷
خیلی عالی و جامع بود ممنون از زحماتتون 🙏🏻🌺
ممنونم از لطف و توجه شما. امیدوارم نکته مفیدی تو ویدیو بود باش برای شما🌷🌷🙏🙏
@@BioCanApply قطعا که مفید بوده... سپاس از شما 🌺🙏🏻
@@sanazhzd زنده باشید واقعا و خیلی خوشحالم از نظر شما🙏🌷🙏
عالی بود خیلی دید خوبی بهم داد👌👌👌👌
خوشحالم که فکر میکنید مفید بود و زنده و شاد باشید🙏🙏👍👍
ممنونم بابت این ویدیو بسیار مفید. بنده هم بعد از آشنایی با شما خیلی بیشتر این نیاز رو در خودم حس کردم که باید این آنالیز هارو یاد بگیرم واقعا کمک بزرگی به بچه ها میکنین 🌹
قربانت عزیز و ما کاری نکردیم. طبیعتا موضوعات نیازهای فیلد و رشته های ما هستن و ما هم داریم سعی میکنیم هر روز اپدیت باشیم واستفاده کنیم و درکنارش با تو و بقیه بچه ها هم همفکری کنیم.
سپاس مجدد از کامنتت
🌹🌹
بژی منال کرماشان
بژی اراد گیان🌷🌹👍
Thanks
Thanks for your comment.
در تکمیل فرمایشاتتون برای اشنایی بچه ها با انالیز های GO که بعد از انالیز های RNA-seq انجام میشه از این دیتابیس ها میشه استفاده کرد امیدوارم برای بچه ها مفید باشه: DAVID, rEnrich, Panther,genemania
ممنون علیرضا عزیز از کامنت و توضیحت. البته این ویب سایت ها یا وب تولز ها محدود به دیتای ار ان ای سک نیستن و برای هر لیستی از ژن ها کاربرد دارن. تعداد این وب تولز ها خیلی خیلی زیاد هستش ولی اگه بخوام دوتا اضافه کنم توضیه میکنم از
Gene set enrichment analysis (GSEA) and gProfiler
استفاده بشه.
البته خیلی بسته به نوع انالیز هم هست مثل همین کار تو شبکه ها میشه با
BiNGO, ClueGO, CluePedia etc.
استفاده کردن. خوشبختانه یادگیری این ها خیلی راحت و هرکدم شاید چند دقیقه وقت بخوان.
سلام وقتتون بخیر. از بین این همه روش های و تکنولوژی هایی که برای سینگل سل وجود دارند (منظورم روش های بدست آوردن ماتریکس هستش) کدوم رو یاد بگیریم آیا لازمه مزایا یا معایب هر کدمو یاد بگیریم؟
با تشکر از تولید محتوای خوبتون
میخواستم بپرسم در کانادا دانشجو های بیولوژی در دوره لیسانس چه مهارت هایی رو یاد میگیرین ؟
من میخوام برای ارشد اپلای کنم اما به دلیل اموزش انلاین از نظر عملی هیچی بلد نیستم خواستم بدونم چه دوره هایی رو باید خارج از دانشگاه شرکت کنم ممنون❤❤
سلام و عرض ادب و ببخشید از تاخیر در جواب دادن. اینجا معمولا دانشجوهای لیسانس می تونن از روش های مختلف و به عنوان های مختلف وارد ازمایشگاه بشن و هر دانشجو بسته به ازمایشگاهی که میره و بک گراند و وقتی که میذاری چیزهایی یاد میگیره و اینطور نیست همه اون ها یک سری تکنیک یا روش مشخص یاد بگیرن. خیلی ها اینجا دنبال یاد گرفتن انالیز دیتا میرن و ماهم وقتی ایران بودیم از اواخر لیسانس این کار رو انجام دادیم و سی وی خوبی برای ما شد.
دوره ها به معنی یادگرفتن نیستن و من توصیه نمیکنم زیاد پولی از این بابت هزینه کنید ولی بابت آشنایی اگه کیفیت خوبی داشته باشن می تونن مفید باشن.
زنده باشی شما🌹🌹❤❤
خیلی ممنون ک تجربیاتتون رو ب اشتراک میزارید.برای بیوانفورماتیک و computational biology بهتره از رشته های تجربی مث بیوتک وارد شیم یا رشته هایی مث مهندسی نرم افزار ؟
(من رشته تجربی بودم و امسال قراره کنکور تجربی بدم در دانشگاه سراسری ن اما دانشگاه غیرانتفاعی می تونم رشته مهندسی کامپیوتر(نرم افزار) بخونم و با تحقیقی ک کردم و جیزهایی ک شما گفتید فکمی کنم با مهندسی کامپیوتر شانس بیشتری برای کار دارم هم تو حوزه زیست شناسی هم بطور کلی)
ممنون میشم راهنماییم کنید
خیلی ممنون از توضیحات کاملتون 🙏🏻 من فقط یک سوال دارم افرادی که هنوز تو هیچ آزمایشگاه یا شرکتی فعالیت نمیکنند و به دیتا های واقعی دسترسی ندارند ، برای تمرین و یادگیری تکنیک های انالیز دیتا ، از کجا دیتا بیارن ؟
سلام و عرض ادب. قربان شما و ممنون از کامنت شما. اصلا نیازی نیست شما تو پروژه ای باشید یا کار ازمایشگاهی کنید. صدها منبع برای این دیتاها وجود دارن که دوتا از مشهور ترین هاش
NCBI-GEO
EBI- ArrayExpress
هستن که تو این ها میلیون ها سمپل وجود دارن برای انالیز. تقریبا این روزا هر مقاله ای با دیتاهای سیکونسینگ چاپ میشن باید دیتا رو رایگان در دسترس بقیه قرار بدن و این دو منبع بیشترین جاهایی هستن که نمونه اپلود میشن. البته لیست این منابع زیاد ولی فک کنم این دو برای شروع خیلی کافی و عالی باشن.
@@BioCanApply kheili mamnoon az rahnamayitun ,motavajeh shodam ✨
@@whitelight7604 زنده باشید شما و به همین دلیل نگران دیتا نباشید به اندازه چاپ ده ها هزار مقاله دیتا اپلود شده و رایگان در دسترس هست.
سلام ممنون از اقای شکور و اقای معین و نیوشا خانم برای تهیه این ویدیوی با ارزش. این پکیج سیرت که معرفی کردین بر اساس زبان آر هست ولی من پایتون بلدم. روشی یا پکیج دیگه ای هست بر اساس پایتون باشه؟
سلام و عرض ادب.. شما خیلی لطف دارید. معین چند بار جواب کامنت شما رو داد ولی نمیدانم چرا حذف میشه تو یوتیوب. یقینا روش های زیادی برای پایتون هم وجود دارن. من جواب معین رو همین زیر برای شما میذارم
Salam, khahesh mikonam, man khodam ba Python analyze nakardam vali package Scanpy khoobe baraye kar kardan
اینم هم لینک
scanpy.readthedocs.io/en/stable/
@@BioCanApply ممنون از راهنماییتون. منم یه لینک فرستادم ببینم این دوره به نظرتون مناسبه ولی هر کار کردم پست نشد
@@zahramohammadi413 ببخشید متاسفانه یوتیوب انگار با کامنت هایی که از ایران میان مشکل داره و متاسفانه من اینجا لینکی نمی بینم. فقط موقعی که نوتیفیکشن پیام اولیه شما امد دیدم تو نوتیفیکیشن یه لینک هست از موسسه مکت خونه. واقعیتش من این موسسه رو نمیشناسم. شخصا هیچوقت ورک شاپ پولی نرفتم و البته تو ایران هیچ ورک شاپی شرکت نکردم. اون ورک شاپ هایی رو هم که شخصا می شناختم افرادش رو کیفیت بالایی نداشتن ولی متاسفانه اصلا با این مرکز و کارها اشنایی ندارم. نهایتا برای یادگیری منبع رایگان با کیفیت زیاد هستش و بیشتر از منبع صبر و تداوم نقش بازی میکنه.
@@BioCanApply بله برای منم پاک میشه. نه این دوره رایگانه و اساتیدش هم اساتید دانشگاه شریف و تهران هستند. حالا اگه دوستان خواستن میتونن استفاده کنن. بله این که واقعا باید وقت گذاشت و چیزی جای تمرین رو نمیگیره ولی خب استاد خوب خیلی زودتر ادمو به نتیجه میرسونه. ممنونم از پاسختون
@@zahramohammadi413 بله درست میگید و من اخیرا شنیدم دوره های این مرکز رایگان هستن و طبیعتا رایگان بودن نشان قصد مثبت داره و امیدوارم خیلی عالی باش و بچه ها استفاده کنن. من خودم ندیدم و نمی تونم نظر بدم ولی به طبع هر دوره ای می تون نکات مفیدی داشته باش. یقینا وجود اطلاعات خیلی می تونه مفید باش و الگوی یادگیری افراد هم متفاوت هستش بعضی ها تو کلاس و با توضیح بهتر یاد میگیرن و بعضی ها با کلاس میانه خوبی ندارن. ممنون از بابت توضیح و خیلی عالی هستش که دوره های رایگان وجود دارن.