U braku samo godinu dana sa Dušanom Vasilićem, nakon čega su se dugo u medijima prepucavali, jer je navodno Seka svom mužu ostala dužna 40 hiljada evra, koje je on uložio u njen album prvenac. Međutim, ona je pokazala činjenica da je snimila dok je radila u Švajcarskoj, te da je sama uložila svojih zarađenih 20 hiljada evra.
2003. godine je Seka Aleksić za svog menadžera uzela Zorana Kovačevića, koji joj je ubrzo postao i emotivni partner, verili i počeli da žive zajedno do 2008. godine. Tada se u medijima spekulisalo da je Zoran bio sa njom samo iz koristi, te da joj je uzimao veliki deo novca od zarada na nastupima.
Onda je bila sa manekenom Mladena Radulovića, pa Veljku Piljkiću, profesi...