Ohue Laboratory, Science Tokyo / 東京科学大学 大上研究室
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Enhancing model learning and interpretation using multiple molecular graph representation
Speaker: Apakorn Kengkanna (Tokyo Institute of Technology)
20th IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology
29-31 August, 2023 - Eindhoven, The Netherlands
cmte.ieee.org/cis-bbtc/cibcb2023/
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AIが加速する創薬・生命科学56:44AIが加速する創薬・生命科学
AIが加速する創薬・生命科学
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NVIDIA GTC 2023（講演番号 SE52316, 2023年3月24日）での講演動画です。 講演者：大上雅史（東京工業大学 情報理工学院 助教） www.li.c.titech.ac.jp
Compound Virtual Screening by Learning-to-Rank with GBDT and NEDCG (IEEE CIBCB 2022)13:08Compound Virtual Screening by Learning-to-Rank with GBDT and NEDCG (IEEE CIBCB 2022)
Compound Virtual Screening by Learning-to-Rank with GBDT and NEDCG (IEEE CIBCB 2022)
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This is a movie of a presentation given at IEEE CIBCB 2022. IEEE CIBCB 2022 cmte.ieee.org/cis-bbtc/cibcb2022/ Paper arxiv.org/abs/2205.02169 Ohue Laboratory www.li.c.titech.ac.jp/en/
情報技術による低分子・中分子創薬SX9:03情報技術による低分子・中分子創薬SX
情報技術による低分子・中分子創薬SX
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東京工業大学 情報理工学院 大上研究室の研究紹介です。 （2021年11月26日収録）
PythonパッケージのPyPI登録手順の紹介41:47PythonパッケージのPyPI登録手順の紹介
PythonパッケージのPyPI登録手順の紹介
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大上研博士課程学生の小杉孝嗣さんによる「PythonパッケージのPyPI登録手順の紹介」の講演です。 Pythonのパッケージレポジトリ「Python Package Index (PyPI)」 (pypi.org) への登録方法を、小杉さんが開発した「QEPPI (Quantitative estimate index for early-stage screening of compounds targeting protein-protein interactions)」を例に紹介しています。QEPPIは低分子化合物がタンパク質間相互作用（PPI）を標的にできそうかどうかを定量的にスコア化できるツールです。前半ではQEPPIの研究紹介、後半ではPyPIパッケージへの登録について、作成ファイルや用意する環境、アップロード方法まで細かく紹介しています。 本講演は、2021年10月1...
Quantitative estimate of protein-protein interaction targeting drug-likeness (IEEE CIBCB 2021)12:55Quantitative estimate of protein-protein interaction targeting drug-likeness (IEEE CIBCB 2021)
Quantitative estimate of protein-protein interaction targeting drug-likeness (IEEE CIBCB 2021)
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This is a movie of a presentation given at IEEE CIBCB 2021. IEEE CIBCB 2021 federation.edu.au/cibcb2021 Paper ieeexplore.ieee.org/document/9562931 QEPPI (GitHub) github.com/ohuelab/QEPPI Extended Journal Paper version Kosugi T, Ohue M. Quantitative estimate index for early-stage screening of compounds targeting protein-protein interactions. International Journal of Molecular Sciences, 22(20): 1...
Drug-target affinity prediction using applicability domain based on data density (IEEE CIBCB 2021)12:39Drug-target affinity prediction using applicability domain based on data density (IEEE CIBCB 2021)
Drug-target affinity prediction using applicability domain based on data density (IEEE CIBCB 2021)
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This is a movie of a presentation given at IEEE CIBCB 2021. IEEE CIBCB 2021 federation.edu.au/cibcb2021 Paper ieeexplore.ieee.org/document/9562808 Ohue Laboratory www.li.c.titech.ac.jp/en/