ИТДБ төслийн хамтарсан судалгааны хөтөлбөрийн зорилго нь Монгол улсын их сургуулийн багш, судлаачдыг Япон Улсын их сургууль, эрдэм шинжилгээний байгууллагуудтай хамтран судалгаа шинжилгээ хийлгэх, ингэснээр олон улсад хүлээн зөвшөөрөгдөх эрдмийн зэрэг, туршлагатай хүний нөөцийг бэлтгэх, тэдний сургалт, судалгааны ажлын агуулга чанар, судалгааны дэд бүтэц, орчинг сайжруулж улс орны нийгэм, эдийн засаг, шинжлэх ухааны хөгжилд оруулах хувь нэмэр, үр өгөөжийг нэмэгдүүлэхэд оршино.